一種基于新冠病毒的全基因組全長(zhǎng)擴(kuò)增的三代建庫(kù)測(cè)序方法
基本信息
| 申請(qǐng)?zhí)?/td> | CN202010536120.9 | 申請(qǐng)日 | - |
| 公開(kāi)（公告）號(hào) | CN111621599A | 公開(kāi)（公告）日 | 2020-09-04 |
| 申請(qǐng)公布號(hào) | CN111621599A | 申請(qǐng)公布日 | 2020-09-04 |
| 分類(lèi)號(hào) | C12Q1/70(2006.01)I | 分類(lèi) | 生物化學(xué)；啤酒；烈性酒；果汁酒；醋；微生物學(xué)；酶學(xué)；突變或遺傳工程; |
| 發(fā)明人 | 方濤 | 申請(qǐng)（專(zhuān)利權(quán)）人 | 武漢菲沙基因信息有限公司 |
| 代理機(jī)構(gòu) | 上海精晟知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 | 代理人 | 武漢菲沙基因信息有限公司 |
| 地址 | 430000湖北省武漢市東湖高新技術(shù)開(kāi)發(fā)區(qū)高新大道666號(hào)武漢國(guó)家生物產(chǎn)業(yè)基地項(xiàng)目B、C、D區(qū)研發(fā)樓B1棟 | ||
| 法律狀態(tài) | - | ||
摘要
| 摘要 | 本發(fā)明公開(kāi)了一種基于新冠病毒的全基因組全長(zhǎng)擴(kuò)增的三代建庫(kù)測(cè)序方法，步驟包括：1)根據(jù)新冠病毒基因組一致性序列設(shè)計(jì)與合成引物；2)新冠病毒基因組全長(zhǎng)擴(kuò)增；3)全基因組擴(kuò)增子樣本混樣；4)文庫(kù)構(gòu)建；5)三代測(cè)序。本發(fā)明通過(guò)結(jié)合奇數(shù)、偶數(shù)引物分別擴(kuò)增，然后將奇數(shù)和偶數(shù)擴(kuò)增片段進(jìn)行混合，可獲得覆蓋整個(gè)新冠病毒基因組的擴(kuò)增子片段，從而僅需要2個(gè)擴(kuò)增反應(yīng)，極大地提高了實(shí)驗(yàn)效率。另外通過(guò)PacBio建庫(kù)流程，在擴(kuò)增子的兩端添加帶有barcode的測(cè)序接頭，即可進(jìn)行PacBio測(cè)序，通過(guò)拆分與數(shù)據(jù)校正后獲得準(zhǔn)確率在99％以上的HiFiReads。?? |
