利用高通量測(cè)序數(shù)據(jù)分析基因融合的方法

基本信息

申請(qǐng)?zhí)?/td> CN201810062150.3 申請(qǐng)日 -
公開(公告)號(hào) CN108304693B 公開(公告)日 2022-02-25
申請(qǐng)公布號(hào) CN108304693B 申請(qǐng)公布日 2022-02-25
分類號(hào) G16B30/10(2019.01)I;G16B20/00(2019.01)I 分類 計(jì)算;推算;計(jì)數(shù);
發(fā)明人 張思文;田埂;梁羽 申請(qǐng)(專利權(quán))人 元碼基因科技(北京)股份有限公司
代理機(jī)構(gòu) 北京科石知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 代理人 高元吉
地址 100102北京市朝陽(yáng)區(qū)廣順北大街5號(hào)融創(chuàng)動(dòng)力A區(qū)4層
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明公開一種利用高通量測(cè)序數(shù)據(jù)分析基因融合的方法。本發(fā)明使用pair?end數(shù)據(jù)作為輸入,對(duì)soft?clip功能不作要求,而且不必需要設(shè)置多個(gè)復(fù)雜參數(shù),根據(jù)比對(duì)信息和后續(xù)過濾條件,檢測(cè)融合并保留融合的序列和位置,對(duì)于單端數(shù)據(jù)量1G的雙端測(cè)序數(shù)據(jù)來說,單對(duì)融合基因的分析僅需不到一小時(shí),且每增加一對(duì)融合基因的分析,僅需增加5至10分鐘。