一種基于半監(jiān)督學(xué)習(xí)框架的T細(xì)胞受體序列分類方法
基本信息
| 申請(qǐng)?zhí)?/td> | CN202010291254.9 | 申請(qǐng)日 | - |
| 公開(kāi)（公告）號(hào) | CN111489792A | 公開(kāi)（公告）日 | 2020-08-04 |
| 申請(qǐng)公布號(hào) | CN111489792A | 申請(qǐng)公布日 | 2020-08-04 |
| 分類號(hào) | G16B40/20(2019.01)I;G06K9/62(2006.01)I | 分類 | - |
| 發(fā)明人 | 王嘉寅;邊浩東;易鑫;張選平;王科;劉濤 | 申請(qǐng)（專利權(quán)）人 | 北京吉因加科技有限公司 |
| 代理機(jī)構(gòu) | 西安通大專利代理有限責(zé)任公司 | 代理人 | 西安交通大學(xué);北京吉因加科技有限公司 |
| 地址 | 710049陜西省西安市咸寧西路28號(hào) | ||
| 法律狀態(tài) | - | ||
摘要
| 摘要 | 本發(fā)明公開(kāi)了一種基于半監(jiān)督學(xué)習(xí)框架的T細(xì)胞受體序列分類方法，選取CDR3β區(qū)域作為輸入數(shù)據(jù)，對(duì)T細(xì)胞受體數(shù)據(jù)進(jìn)行特征編碼；根據(jù)得到的數(shù)據(jù)，選擇支持向量機(jī)、隨機(jī)森林和決策樹(shù)的監(jiān)督學(xué)習(xí)算法分別構(gòu)造初始分類器C1、C2、C3；對(duì)初始分類器C1、C2、C3進(jìn)行訓(xùn)練得到擴(kuò)充的新訓(xùn)練集，產(chǎn)生的訓(xùn)練集進(jìn)行可重復(fù)取樣獲得三個(gè)有標(biāo)記訓(xùn)練集，然后從每個(gè)新訓(xùn)練集產(chǎn)生一個(gè)分類器，對(duì)分類器進(jìn)行迭代更新；訓(xùn)練完成后，將三個(gè)分類器C1、C2、C3通過(guò)投票機(jī)制作為一個(gè)分類器集成進(jìn)行使用。本發(fā)明適用于T細(xì)胞受體序列數(shù)據(jù)難以獲得的情況，性能顯著優(yōu)于現(xiàn)有方法。?? |
