篩選微衛(wèi)星位點的方法及其應(yīng)用

基本信息

申請?zhí)?/td> CN202110042650.2 申請日 -
公開（公告）號 CN112662740B 公開（公告）日 2022-06-10
申請公布號 CN112662740B 申請公布日 2022-06-10
分類號 C12Q1/6809（2018.01）I;C12Q1/6858（2018.01）I;C12N15/11（2006.01）I 分類 生物化學；啤酒；烈性酒；果汁酒；醋；微生物學；酶學；突變或遺傳工程;
發(fā)明人 常壹昭;肖姍姍;王濤 申請（專利權(quán)）人 杭州瑞普基因科技有限公司
代理機構(gòu) 北京清亦華知識產(chǎn)權(quán)代理事務(wù)所（普通合伙） 代理人 -
地址 311100浙江省杭州市余杭區(qū)五常街道聯(lián)創(chuàng)街188號貝達夢工場D座7-10層
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明提出一種篩選微衛(wèi)星位點的方法，該方法包括：（1）對已知微衛(wèi)星穩(wěn)定性狀態(tài)的樣本進行測序，以便獲得包含待分析微衛(wèi)星位點的測序讀段；（2）基于所獲得的測序讀段，采用下列兩種方式至少之一進行微衛(wèi)星位點的篩選：（a）將所述測序讀段與參考序列進行比對，獲得包含所述待分析微衛(wèi)星位點的測序讀段的讀段數(shù)目及讀段長度，獲得目標微衛(wèi)星位點；和（b）基于包含待分析微衛(wèi)星位點的測序讀段在所述已知微衛(wèi)星穩(wěn)定性狀態(tài)的樣本中的step?wise difference值，獲得目標微衛(wèi)星位點。利用本發(fā)明的方法可以準確判斷備選微衛(wèi)星位點是否適合作為判定待檢測樣本微衛(wèi)星穩(wěn)定性的位點，使得所選擇的微衛(wèi)星位點可以準確判斷待檢測樣本的微衛(wèi)星穩(wěn)定性的屬性。