一種腫瘤突變肽MHC親和力預(yù)測方法及其應(yīng)用

基本信息

申請?zhí)?/td> CN201811448569.9 申請日 -
公開（公告）號 CN109682978A 公開（公告）日 2019-04-26
申請公布號 CN109682978A 申請公布日 2019-04-26
分類號 G01N33/68（2006.01）I 分類 測量；測試;
發(fā)明人 丁平 申請（專利權(quán)）人 四川康德賽醫(yī)療科技有限公司
代理機構(gòu) 北京中政聯(lián)科專利代理事務(wù)所（普通合伙） 代理人 丁平;四川康德賽醫(yī)療科技有限公司
地址 102209 北京市昌平區(qū)北清路TBD云集中心1號樓6層
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明提出了一種腫瘤突變肽MHC親和力的預(yù)測方法，包括如下步驟：(一)腫瘤特異性突變序列的獲??；(二)對突變肽MHC親和力預(yù)測，以所述突變序列翻譯成預(yù)定長度的氨基酸FASTA序列，獲得測試肽；對所述測試肽分別進行與MHCI分子、MHCII分子的親和力評估，按照確定的等級標準篩選突變肽；(三)對步驟(二)中篩選出的具有高親和力所述突變肽，進行蛋白酶體切割預(yù)測，篩選出能夠被蛋白酶體有效切割的所述突變肽；(四)實驗驗證實驗合成步驟(三)驗證突變肽與患者特有MHC的親和力。本發(fā)明還提出了一種基于腫瘤突變肽MHC親和力的預(yù)測方法在篩選腫瘤新生抗原及制備個性化腫瘤疫苗中的用途。