一種腫瘤突變肽MHC親和力預(yù)測(cè)方法及其應(yīng)用
基本信息
| 申請(qǐng)?zhí)?/td> | CN201811448569.9 | 申請(qǐng)日 | - |
| 公開(kāi)（公告）號(hào) | CN109682978B | 公開(kāi)（公告）日 | 2020-07-03 |
| 申請(qǐng)公布號(hào) | CN109682978B | 申請(qǐng)公布日 | 2020-07-03 |
| 分類(lèi)號(hào) | C12Q1/6886 | 分類(lèi) | 生物化學(xué)；啤酒；烈性酒；果汁酒；醋；微生物學(xué)；酶學(xué)；突變或遺傳工程; |
| 發(fā)明人 | 丁平 | 申請(qǐng)（專(zhuān)利權(quán)）人 | 四川康德賽醫(yī)療科技有限公司 |
| 代理機(jī)構(gòu) | 北京中政聯(lián)科專(zhuān)利代理事務(wù)所（普通合伙） | 代理人 | 四川康德賽醫(yī)療科技有限公司;丁平 |
| 地址 | 610093 四川省成都市高新區(qū)科園南路88號(hào)12棟201號(hào) | ||
| 法律狀態(tài) | - | ||
摘要
| 摘要 | 本發(fā)明提出了一種腫瘤突變肽MHC親和力的預(yù)測(cè)方法，包括如下步驟：(一)腫瘤特異性突變序列的獲?。?二)對(duì)突變肽MHC親和力預(yù)測(cè)，以所述突變序列翻譯成預(yù)定長(zhǎng)度的氨基酸FASTA序列，獲得測(cè)試肽；對(duì)所述測(cè)試肽分別進(jìn)行與MHCI分子、MHCII分子的親和力評(píng)估，按照確定的等級(jí)標(biāo)準(zhǔn)篩選突變肽；(三)對(duì)步驟(二)中篩選出的具有高親和力所述突變肽，進(jìn)行蛋白酶體切割預(yù)測(cè)，篩選出能夠被蛋白酶體有效切割的所述突變肽；(四)實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)合成步驟(三)驗(yàn)證突變肽與患者特有MHC的親和力。本發(fā)明還提出了一種基于腫瘤突變肽MHC親和力的預(yù)測(cè)方法在篩選腫瘤新生抗原及制備個(gè)性化腫瘤疫苗中的用途。 |
