結(jié)核分枝桿菌多線耐藥基因鑒定的方法和裝置

基本信息

申請(qǐng)?zhí)?/td> CN202010382675.2 申請(qǐng)日 -
公開（公告）號(hào) CN113621716A 公開（公告）日 2021-11-09
申請(qǐng)公布號(hào) CN113621716A 申請(qǐng)公布日 2021-11-09
分類號(hào) C12Q1/689（2018.01）I;C12N15/11（2006.01）I;G16B30/10（2019.01）I;G16B20/20（2019.01）I 分類 生物化學(xué)；啤酒；烈性酒；果汁酒；醋；微生物學(xué)；酶學(xué)；突變或遺傳工程;
發(fā)明人 毛宛司;謝植豪;袁劍穎;李英鎮(zhèn) 申請(qǐng)（專利權(quán)）人 華大生物科技（武漢）有限公司
代理機(jī)構(gòu) 深圳鼎合誠知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 代理人 彭家恩;羅瑤
地址 518057廣東省深圳市南山區(qū)粵海街道高新區(qū)社區(qū)高新南四道025號(hào)高新工業(yè)村W2A棟、B棟A棟201203A5
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 一種結(jié)核分枝桿菌多線耐藥基因鑒定的方法和裝置，該方法包括：獲取樣本的宏基因組測(cè)序得到的全基因組序列或基于靶向擴(kuò)增測(cè)序得到的結(jié)核分枝桿菌耐藥靶標(biāo)區(qū)域的序列并進(jìn)行數(shù)據(jù)質(zhì)控；將數(shù)據(jù)質(zhì)控后的序列比對(duì)到結(jié)核分枝桿菌基因組上，進(jìn)行排序并篩選出符合質(zhì)量要求的比對(duì)結(jié)果；將比對(duì)位置位于結(jié)核分枝桿菌耐藥基因數(shù)據(jù)庫中的變異位點(diǎn)所在的基因區(qū)域的序列進(jìn)行局部組裝并進(jìn)行變異檢測(cè)；將變異檢測(cè)的結(jié)果，根據(jù)變異位點(diǎn)在基因組上的位置和突變類型，注釋到結(jié)核分枝桿菌耐藥基因數(shù)據(jù)庫上；基于注釋結(jié)果輸出結(jié)核分枝桿菌耐藥基因數(shù)據(jù)庫中每個(gè)藥物耐藥相關(guān)突變位點(diǎn)的檢測(cè)結(jié)果。本發(fā)明能夠在一次檢測(cè)中覆蓋多種藥物及其對(duì)應(yīng)的耐藥位點(diǎn)，檢測(cè)精度高。