一種用于宏基因組學(xué)病原體檢測(cè)參考閾值建立的方法

基本信息

申請(qǐng)?zhí)?/td> CN202110895536.4 申請(qǐng)日 -
公開（公告）號(hào) CN113571128A 公開（公告）日 2021-10-29
申請(qǐng)公布號(hào) CN113571128A 申請(qǐng)公布日 2021-10-29
分類號(hào) G16B20/00（2019.01）I;G16B25/20（2019.01）I;G16B30/10（2019.01）I;G16B40/00（2019.01）I;C12Q1/6869（2018.01）I;C12Q1/04（2006.01）I 分類 物理
發(fā)明人 申奧;吳紅龍 申請(qǐng)（專利權(quán)）人 華大生物科技（武漢）有限公司
代理機(jī)構(gòu) 北京紀(jì)凱知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 代理人 張立娜
地址 518052廣東省深圳市前海深港合作區(qū)南山街道臨海大道59號(hào)海運(yùn)中心口岸樓0605A房
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明公開了一種用于宏基因組學(xué)病原體檢測(cè)參考閾值建立的方法。該方法包括：確定臨床樣本類型；確定其組成成分及人源細(xì)胞含量分布范圍；設(shè)置梯度陰性對(duì)照；對(duì)陰性對(duì)照樣本按照待測(cè)臨床樣本即將進(jìn)行的宏基因組檢測(cè)流程進(jìn)行多批次重復(fù)測(cè)試；統(tǒng)計(jì)不同人源細(xì)胞濃度的陰性對(duì)照樣本中不同病原體的檢測(cè)序列數(shù)，得到對(duì)應(yīng)病原體在不同人源細(xì)胞濃度的陰性對(duì)照樣本的檢測(cè)序列數(shù)波動(dòng)區(qū)間；以對(duì)應(yīng)病原體在陰性對(duì)照樣本中的檢測(cè)序列數(shù)波動(dòng)區(qū)間上限的120％為閾值。本發(fā)明能實(shí)現(xiàn)樣本檢測(cè)結(jié)果分層判別，提高宏基因組學(xué)病原檢測(cè)結(jié)果準(zhǔn)確性；可提高報(bào)告解讀效率；可有效減少宏基因組檢測(cè)結(jié)果的假陽(yáng)性；可實(shí)時(shí)評(píng)估檢測(cè)流程中的污染，指導(dǎo)實(shí)驗(yàn)室流程改進(jìn)。