肝癌早篩模型的構(gòu)建方法、檢測(cè)裝置以及計(jì)算機(jī)可讀取介質(zhì)

基本信息

申請(qǐng)?zhí)?/td> CN202110753791.5 申請(qǐng)日 -
公開(kāi)（公告）號(hào) CN113421608A 公開(kāi)（公告）日 2021-09-21
申請(qǐng)公布號(hào) CN113421608A 申請(qǐng)公布日 2021-09-21
分類號(hào) G16B5/00（2019.01）I;G16B30/10（2019.01）I;G16B35/20（2019.01）I;G16B40/00（2019.01）I;G16B50/00（2019.01）I;G16H50/50（2018.01）I;G06N3/04（2006.01）I;G06N3/08（2006.01）I 分類 物理
發(fā)明人 劉睿;包華;吳雪;吳舒雨;魏玉林;包海榮;邵陽(yáng);楊珊珊;朱柳青;崔月利;劉璟文 申請(qǐng)（專利權(quán)）人 南京世和基因生物技術(shù)股份有限公司
代理機(jī)構(gòu) - 代理人 -
地址 210032江蘇省南京市高新開(kāi)發(fā)區(qū)新錦湖路3-1號(hào)中丹生態(tài)生命科學(xué)產(chǎn)業(yè)園02棟18樓
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明涉及肝癌早篩模型的構(gòu)建方法、檢測(cè)裝置以及計(jì)算機(jī)可讀取介質(zhì)。對(duì)170例對(duì)照人群和192例肝癌患者的WGS cfDNA讀段長(zhǎng)度進(jìn)行統(tǒng)計(jì)，發(fā)現(xiàn)在總片段（40?300bp），短片段（40?80bp）和超長(zhǎng)片段（200?300bp）的數(shù)量在兩組間存在差異；同時(shí)以染色體長(zhǎng)短臂統(tǒng)計(jì)不同長(zhǎng)度片段的數(shù)量，在兩組間也存在顯著差異。本發(fā)明首次基于血漿cfDNA高通量低深度測(cè)序提供了DNA片段大小片單分布和末端序列占比與肝癌關(guān)系的診斷模型，該模型不僅能夠診斷早期肝癌還能夠區(qū)分肝硬化，具有無(wú)創(chuàng)檢測(cè)，通量低，檢測(cè)特異性和敏感性高的有點(diǎn)。