一種基于單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)唯一片段序列捕獲方法
基本信息
| 申請(qǐng)?zhí)?/td> | CN202011200039.X | 申請(qǐng)日 | - |
| 公開(kāi)（公告）號(hào) | CN112309500A | 公開(kāi)（公告）日 | 2021-02-02 |
| 申請(qǐng)公布號(hào) | CN112309500A | 申請(qǐng)公布日 | 2021-02-02 |
| 分類(lèi)號(hào) | G16B30/00(2019.01)I; | 分類(lèi) | 物理 |
| 發(fā)明人 | 潘星華;林貫川;黃仲曦;章建平 | 申請(qǐng)（專(zhuān)利權(quán)）人 | 廣州序科碼生物技術(shù)有限責(zé)任公司 |
| 代理機(jī)構(gòu) | 廣州三環(huán)專(zhuān)利商標(biāo)代理有限公司 | 代理人 | 顏希文 |
| 地址 | 510530廣東省廣州市高新技術(shù)產(chǎn)業(yè)開(kāi)發(fā)區(qū)科學(xué)城開(kāi)源大道11號(hào)B3棟905室 | ||
| 法律狀態(tài) | - | ||
摘要
| 摘要 | 本發(fā)明提供了一種基于單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)捕獲唯一片段序列的方法，其特征在于，包括以下步驟：基于單細(xì)胞測(cè)序文庫(kù)中的DNA片段，以DNA片段上前10bp?20bp堿基作為識(shí)別序列，對(duì)含有相同所述識(shí)別序列的DNA片段進(jìn)行歸類(lèi)，通過(guò)計(jì)算機(jī)軟件將同類(lèi)型的DNA片段生成一個(gè)數(shù)據(jù)集，從該數(shù)據(jù)集獲得用于分析單細(xì)胞全基因組唯一序列。本發(fā)明使用生物信息學(xué)手段進(jìn)行數(shù)據(jù)識(shí)別，使得在基因組建庫(kù)過(guò)程中無(wú)需設(shè)計(jì)和通過(guò)實(shí)驗(yàn)插入含有UMI的固有接頭序列，簡(jiǎn)化了單細(xì)胞測(cè)序過(guò)程，并縮短了時(shí)間和降低因接頭序列過(guò)長(zhǎng)所導(dǎo)致的引物二聚體形成的發(fā)生概率。本方法在測(cè)序數(shù)據(jù)分析之前即可去除重復(fù)的序列，對(duì)于拷貝數(shù)變異分析而言，無(wú)其它相同的序列混雜，只剩下唯一的序列片段，即可更忠實(shí)的反應(yīng)基因組的情況。?? |
