用于在基因芯片中將外顯子探針信號值轉化為轉錄本結構與濃度的方法

基本信息

申請?zhí)?/td> CN201310284395.8 申請日 -
公開（公告）號 CN104112083B 公開（公告）日 2016-11-09
申請公布號 CN104112083B 申請公布日 2016-11-09
分類號 G06F19/16 分類 計算；推算；計數;
發(fā)明人 王效智;李奇 申請（專利權）人 上海其明信息技術有限公司
代理機構 北京金信知識產權代理有限公司 代理人 劉鋒;黃小棟
地址 201210 上海市浦東新區(qū)張江路665號907室
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明公開了一種用于在基因芯片中將外顯子探針信號值轉化為轉錄本結構與濃度的方法，包括以下步驟：S100，對該多個探針的初始信號值進行處理，獲得轉錄本和探針的初始結構關系矩陣以及轉錄本和樣本的初始濃度關系矩陣；S200，從已知轉錄本數據庫中分別選取與該初始結構關系矩陣內每個結構關系數列階梯距離最短的最小階梯距離標準數列；S300，確定各該結構關系數列的最近似標準數列；S400，根據各該結構關系數列的最近似標準數列，將該初始濃度關系矩陣調整為最終的預測濃度關系矩陣。通過本發(fā)明得出的轉錄本結構和濃度與實驗驗證結果具有很好的一致性，并可為后續(xù)試驗提供可靠參考。