一種鑒別東北地區(qū)黃芩的SSR分子標記引物及方法

基本信息

申請?zhí)?/td> CN202011048452.9 申請日 -
公開（公告）號 CN113684291A 公開（公告）日 2021-11-23
申請公布號 CN113684291A 申請公布日 2021-11-23
分類號 C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11 分類 生物化學(xué)；啤酒；烈性酒；果汁酒；醋；微生物學(xué)；酶學(xué)；突變或遺傳工程;
發(fā)明人 王繼永;鄭司浩;曾燕;劉美娟;尚興樸;梁煥;趙莎;王浩;李九如;高強;靜一;劉國城;孫文靜 申請（專利權(quán)）人 中國中藥有限公司
代理機構(gòu) 北京知聯(lián)天下知識產(chǎn)權(quán)代理事務(wù)所（普通合伙） 代理人 張陸軍;張迎新
地址 100195 北京市海淀區(qū)西四環(huán)北路15號依斯特大廈8層
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明提供一種鑒別東北地區(qū)黃芩的SSR分子標記引物及方法，方法包括如下步驟：以待鑒定黃芩樣本的總DNA為模板，用SSR分子標記引物進行PCR擴增，得到擴增產(chǎn)物；對擴增產(chǎn)物進行毛細管電泳測序分型，得到擴增產(chǎn)物的分型結(jié)果；將擴增產(chǎn)物的分型結(jié)果用GeneMarker4.0進行峰圖判讀，得到等位基因矩陣；根據(jù)等位基因矩陣，通過GenALEx計算黃芩的遺傳多樣性數(shù)據(jù)；基于GenALEx計算所得的遺傳多樣性數(shù)據(jù)，通過MEGA進行UPGMA聚類分析，構(gòu)建聚類樹。本發(fā)明應(yīng)用基因組技術(shù)及SSR分子標記技術(shù)，利用黃芩基因組設(shè)計SSR引物，并通過河北、山西、山東、陜西、內(nèi)蒙古、遼寧、吉林等地的黃芩樣本篩選SSR引物，用于特異性鑒別東北地區(qū)黃芩樣本，準確度高、穩(wěn)定性強、易于大范圍推廣應(yīng)用。