基于高通量測序技術的宿主中病毒來源sRNA數(shù)據(jù)分析方法

基本信息

申請?zhí)?/td> CN202110354949.1 申請日 -
公開（公告）號 CN113066532A 公開（公告）日 2021-07-02
申請公布號 CN113066532A 申請公布日 2021-07-02
分類號 G16B20/30;G16B30/10;G16B45/00 分類 物理
發(fā)明人 肖云平;徐天生;楊雨晴;劉鈺釧;史賢俊;林博 申請（專利權）人 上海歐易生物醫(yī)學科技有限公司
代理機構 上海德禾翰通律師事務所 代理人 夏思秋
地址 201114 上海市閔行區(qū)浦江鎮(zhèn)新駿環(huán)路138號5幢302室
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明提出了一種基于高通量測序技術的宿主中病毒來源sRNA數(shù)據(jù)分析方法，包括文件準備步驟、下機數(shù)據(jù)質控步驟、病毒參考基因組比對以及病毒sRNA注釋步驟、病毒sRNA定量步驟、差異病毒sRNA分析步驟、宿主靶基因預測步驟、富集分析步驟、網(wǎng)頁版報告整理步驟。本發(fā)明結果全面，包含涉及到的病毒sRNA分析內容以及其宿主靶基因預測，GO、KEGG富集分析以及對應的可視化展示；自動整理所有分析結果，每一步分析完成之后自動對結果進行匯總統(tǒng)計、可視化以及邏輯化歸類整理，結果文件可直接用于生成網(wǎng)頁版報告，所有操作步驟可以溯源，方便錯誤查詢，如果分析有報錯，會生成對應的報錯日志信息。