一種基于CRISPR-Cas9技術(shù)設(shè)計(jì)點(diǎn)突變模型的方法及系統(tǒng)

基本信息

申請(qǐng)?zhí)?/td> CN202010205993.1 申請(qǐng)日 -
公開(kāi)（公告）號(hào) CN111508558A 公開(kāi)（公告）日 2020-08-07
申請(qǐng)公布號(hào) CN111508558A 申請(qǐng)公布日 2020-08-07
分類號(hào) G16B20/20 分類 -
發(fā)明人 高翠;黎肖容 申請(qǐng)（專利權(quán)）人 廣州賽業(yè)百沐生物科技有限公司
代理機(jī)構(gòu) 廣州嘉權(quán)專利商標(biāo)事務(wù)所有限公司 代理人 廣州賽業(yè)百沐生物科技有限公司
地址 510663 廣東省廣州市黃埔區(qū)神舟路288號(hào)C棟1401房、1501房、1601房
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明公開(kāi)了一種基于CRISPR?Cas9技術(shù)設(shè)計(jì)點(diǎn)突變模型的方法及系統(tǒng)，方法包括：1)確定點(diǎn)突變模型動(dòng)物的突變位點(diǎn)；2)根據(jù)突變信息計(jì)算突變點(diǎn)所在目標(biāo)外顯子或者突變位點(diǎn)最臨近的外顯子的編碼范圍；3)gRNA設(shè)計(jì)：在突變點(diǎn)上下游50bp范圍內(nèi)設(shè)計(jì)gRNA，計(jì)算并基于gRNA的脫靶分值、gRNA序列分值、gRNA切割位置與突變點(diǎn)的相對(duì)位置分值、gRNA回切分值確定不同gRNA序列總分值，基于總分值確定候選gRNA序列；4)輸出設(shè)計(jì)方案。本發(fā)明的一些實(shí)例，可以基于現(xiàn)有的信息自動(dòng)設(shè)計(jì)出可用的點(diǎn)突變模型，大大提升了方案的質(zhì)量，提高實(shí)驗(yàn)成功率，減輕了對(duì)于熟練實(shí)驗(yàn)人員的依賴；可以篩選出效率更佳的點(diǎn)突變模型設(shè)計(jì)方案，有利于提高點(diǎn)突變模型的構(gòu)建成功率或效率。