一種基于TopoMA定量構(gòu)效關(guān)系模型的藥物設(shè)計方法

基本信息

申請?zhí)?/td> CN202011085973.1 申請日 -
公開（公告）號 CN112102900A 公開（公告）日 2020-12-18
申請公布號 CN112102900A 申請公布日 2020-12-18
分類號 G16C20/50;G16C20/70;G16C20/90;G16C20/80 分類 物理
發(fā)明人 馬松齡;馬文志;賴力鵬;溫書豪;馬健 申請（專利權(quán)）人 北京晶泰科技有限公司
代理機構(gòu) 深圳市科吉華烽知識產(chǎn)權(quán)事務(wù)所（普通合伙） 代理人 北京晶派科技有限公司
地址 100083 北京市海淀區(qū)中關(guān)村東路8號東升大廈C座三層333單元
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明提供一種基于TopoMA定量構(gòu)效關(guān)系模型的藥物設(shè)計方法，包括：步驟（1）:在一個化合物上指定若干非環(huán)單鍵，通過所述非環(huán)單鍵將化合物分割出多個側(cè)鏈；步驟（2）：對于步驟（1）中分割出的每條側(cè)鏈，TopoMA會執(zhí)行側(cè)鏈對齊至定位基、手性檢查與調(diào)整、單鍵二面角調(diào)整以及非平面環(huán)檢查與調(diào)整；步驟（3）：對側(cè)鏈進行CoMFA分析，通過SP3碳原子探針計算側(cè)鏈在三維空間中的立體場描述符與靜電場描述符，將每個分子三維格點的描述符平鋪為一維向量，由多個分子的描述符組成矩陣，每個分子產(chǎn)生一個特征向量；步驟（4）：建立分子描述符與生物活性數(shù)據(jù)之間關(guān)系的模型。相對于Topomer CoMFA方法采用PLS建模的單一建模方法而言，本發(fā)明有更大可能得到更好的模型。