一種單細胞ATAC-seq數(shù)據(jù)分析方法

基本信息

申請?zhí)?/td> CN201910768671.5 申請日 -
公開（公告）號 CN110544509A 公開（公告）日 2021-06-11
申請公布號 CN110544509A 申請公布日 2021-06-11
分類號 G16B30/00 分類 物理
發(fā)明人 夏昊強;高川;周煌凱;張羽;陶勇;羅玥;陳飛欽;曾川川 申請（專利權(quán)）人 廣州基迪奧生物科技有限公司
代理機構(gòu) 廣州三環(huán)專利商標代理有限公司 代理人 顏希文;宋靜娜
地址 510000 廣東省廣州市廣州國際生物島螺旋三路6號第五層501、502單元
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明提供一種單細胞ATAC?seq數(shù)據(jù)分析方法，包括以下步驟：步驟S1,對測序原始數(shù)據(jù)進行數(shù)據(jù)分析與質(zhì)控；步驟S2,比對分析；步驟S3,插入片段分析；步驟S4,富集區(qū)域Peak分析；步驟S5,單細胞亞群分類；步驟S6,對Peak相關(guān)基因進行注釋和富集；步驟S7,TF?motif分析；步驟S8,亞群可及性差異分析；步驟S9,差異可及性位點相關(guān)基因分析，對鑒定出的差異TF?motif所在peak區(qū)域最鄰近的轉(zhuǎn)錄起始位點所對應(yīng)的基因注釋等步驟。本發(fā)明構(gòu)建了一個全面、分析內(nèi)容豐富的單細胞ATAC?seq數(shù)據(jù)分析流程，分析結(jié)果揭示了大量的生物信息，方便人們深入挖掘蘊藏在單細胞水平內(nèi)的生物學(xué)現(xiàn)象和特征，分析流程及結(jié)果以html的形式進行可視化展示，分析內(nèi)容層次明了，結(jié)果展現(xiàn)形式多樣，增加了報告的可讀性。