一種單細(xì)胞免疫組庫測(cè)序數(shù)據(jù)的分析方法
基本信息
| 申請(qǐng)?zhí)?/td> | CN201910246761.8 | 申請(qǐng)日 | - |
| 公開（公告）號(hào) | CN109979528B | 公開（公告）日 | 2021-06-25 |
| 申請(qǐng)公布號(hào) | CN109979528B | 申請(qǐng)公布日 | 2021-06-25 |
| 分類號(hào) | G16B20/00;G16B30/00 | 分類 | 物理 |
| 發(fā)明人 | 周煌凱;夏昊強(qiáng);高川;張羽;陶勇;羅玥;邢燕;曾川川 | 申請(qǐng)（專利權(quán)）人 | 廣州基迪奧生物科技有限公司 |
| 代理機(jī)構(gòu) | 廣州三環(huán)專利商標(biāo)代理有限公司 | 代理人 | 顏希文;宋靜娜 |
| 地址 | 510000 廣東省廣州市廣州國際生物島螺旋三路6號(hào)第五層501、502單元 | ||
| 法律狀態(tài) | - | ||
摘要
| 摘要 | 本發(fā)明公開了一種單細(xì)胞免疫組庫測(cè)序數(shù)據(jù)的分析方法，包括如下步驟：步驟S1，原始數(shù)據(jù)進(jìn)行數(shù)據(jù)質(zhì)量統(tǒng)計(jì)與基本質(zhì)控；步驟S2,對(duì)步驟S1所得的高質(zhì)量的reads與參考V（D）J fragments序列進(jìn)行序列比對(duì)及注釋，得到Consensus序列；步驟S3，對(duì)步驟S2拼接得到的Consensus中的CDR3氨基酸序列進(jìn)行Clonotype分型分型；步驟S4，對(duì)步驟S3所得樣本中的Clonotype進(jìn)行CDR3、V/J基因、V?J paired特征分析；步驟S5，將不同樣本中的clonotype進(jìn)行合并，然后進(jìn)行多樣本分析。該方法分析流程完整，內(nèi)容豐富，結(jié)果能夠可視化展示，能夠全面揭示免疫組庫信息，從而使用戶能夠全面了解評(píng)估免疫組庫狀況，可以更精確地反應(yīng)生物體內(nèi)的免疫功能。 |
