一種用于校正擴增子測序中擴增偏差的方法

基本信息

申請?zhí)?/td> CN201780090677.0 申請日 -
公開（公告）號 CN110741094A 公開（公告）日 2020-01-31
申請公布號 CN110741094A 申請公布日 2020-01-31
分類號 C12Q1/6806;G16B25/20 分類 生物化學；啤酒；烈性酒；果汁酒；醋；微生物學；酶學；突變或遺傳工程;
發(fā)明人 吳鏑;張海川 申請（專利權）人 賽雷納（中國）醫(yī)療科技有限公司
代理機構 成都欣圣知識產(chǎn)權代理有限公司 代理人 賽雷納（中國）醫(yī)療科技有限公司
地址 610000 四川省成都市高新區(qū)科園南路88號B1-902
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明公開了一種校正擴增子測序中擴增偏差的方法，通過擴增靶核酸，獲取靶核酸的擴增子覆蓋度，計算每個測試基因組區(qū)域靶核酸和參考基因組區(qū)域靶核酸之間的擴增子覆蓋度比值，去除異常值，應用公式對擴增子覆蓋度比值進行歸一化，計算測試基因組區(qū)域擴增子和參考基因組區(qū)域擴增子之間各項參數(shù)的差值和應用另一公式擬合數(shù)據(jù)等步驟，將通過擬合計算得出的回歸參數(shù)值用于校正擴增偏差，得到去除擴增偏差后的歸一化擴增子覆蓋度比值，從而消除了多重PCR擴增過程中因實驗因素引起的擴增偏差。擴增偏差的消除有利于目標基因組區(qū)域拷貝數(shù)的精確計算，從而使應用擴增子測序數(shù)據(jù)檢測微小拷貝數(shù)的變異成為可能。