計(jì)算基因型對表型額外貢獻(xiàn)的方法及裝置

基本信息

申請?zhí)?/td> CN201710669992.0 申請日 -
公開（公告）號 CN107315922A 公開（公告）日 2017-11-03
申請公布號 CN107315922A 申請公布日 2017-11-03
分類號 G06F19/00(2011.01)I 分類 計(jì)算；推算；計(jì)數(shù);
發(fā)明人 朱天生;范嘉庚;劉艷波 申請（專利權(quán)）人 杭州祥音醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)實(shí)驗(yàn)室有限公司
代理機(jī)構(gòu) 北京超凡志成知識產(chǎn)權(quán)代理事務(wù)所（普通合伙） 代理人 杭州祥音生物醫(yī)藥科技有限公司;杭州祥音醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)實(shí)驗(yàn)室有限公司
地址 310000 浙江省杭州市西湖區(qū)翠苑街道翠苑二區(qū)18-2幢115室
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明提供了計(jì)算基因型對表型額外貢獻(xiàn)的方法及裝置，涉及生物信息學(xué)技術(shù)領(lǐng)域，其中，該計(jì)算基因型對表型額外貢獻(xiàn)的方法包括：首先，通過權(quán)威文獻(xiàn)及生物數(shù)據(jù)庫獲取基因多態(tài)性位點(diǎn)信息，其中，基因多態(tài)性位點(diǎn)信息包括表型、基因型、基因頻率和OR值，之后，按照基因多態(tài)性位點(diǎn)信息對應(yīng)的表型將物種細(xì)分為多個(gè)亞類，接著，根據(jù)基因頻率和OR值計(jì)算每種亞類中各個(gè)基因型的平均貢獻(xiàn)值，然后，對單個(gè)待測試物種進(jìn)行基因多態(tài)性位點(diǎn)檢測，獲取待測試物種的特定基因型，最后，根據(jù)OR值和平均貢獻(xiàn)值計(jì)算特定基因型的對表型額外貢獻(xiàn)值，通過上述方法能夠方便快捷的計(jì)算出基因型對表型的額外貢獻(xiàn)。