一種高通量測序數(shù)據(jù)匹配方法

基本信息

申請(qǐng)?zhí)?/td> CN201410376285.9 申請(qǐng)日 -
公開（公告）號(hào) CN105320850A 公開（公告）日 2016-02-10
申請(qǐng)公布號(hào) CN105320850A 申請(qǐng)公布日 2016-02-10
分類號(hào) G06F19/22(2011.01)I 分類 計(jì)算；推算；計(jì)數(shù);
發(fā)明人 張藝;何飛;馬豐收;鄒曉文 申請(qǐng)（專利權(quán)）人 晶能生物技術(shù)（上海）有限公司
代理機(jī)構(gòu) - 代理人 -
地址 201111 上海市閔行區(qū)元江路5500號(hào)第2幢1187室
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明屬于在分子生物學(xué)技術(shù)領(lǐng)域，本發(fā)明屬于分子生物信息檢測領(lǐng)域，具體涉及在已有高通量DNA測序數(shù)據(jù)匹配基礎(chǔ)上，基于環(huán)境平臺(tái)修正因子增加測序數(shù)據(jù)的匹配數(shù)量，以提高測序數(shù)據(jù)的利用率的一種高通量DNA測序數(shù)據(jù)匹配方法。本發(fā)明包括：獲取測序數(shù)據(jù)；初步匹配高通量DNA測序數(shù)據(jù)得到匹配成功數(shù)據(jù)集和匹配失敗數(shù)據(jù)集；設(shè)置基于實(shí)驗(yàn)平臺(tái)和環(huán)境的匹配修正因子k；用基于修正因子k的模型對(duì)匹配失敗集中數(shù)據(jù)重新匹配；提取測序數(shù)據(jù)匹配失敗集中成功匹配數(shù)據(jù)。本發(fā)明在原有高通量DNA測序數(shù)據(jù)匹配映射基礎(chǔ)上，通過評(píng)估匹配失敗測序數(shù)據(jù)集中數(shù)據(jù)發(fā)生成功匹配的可能，進(jìn)一步增加成功匹配映射的數(shù)據(jù)數(shù)量，以提高測序數(shù)據(jù)的利用率。