一種轉(zhuǎn)錄本的分類方法

基本信息

申請?zhí)?/td> CN201910388054.2 申請日 -
公開（公告）號 CN111916147A 公開（公告）日 2020-11-10
申請公布號 CN111916147A 申請公布日 2020-11-10
分類號 G16B20/00(2019.01)I;G16B30/10(2019.01)I 分類 物理
發(fā)明人 封力;湯冬;王毓博;李凈凈;梁帆;胡江;汪德鵬 申請（專利權(quán)）人 武漢希望組生物科技有限公司
代理機(jī)構(gòu) 武漢河山金堂專利事務(wù)所（普通合伙） 代理人 胡清堂
地址 430000 湖北省武漢市東湖新技術(shù)開發(fā)區(qū)花城大道8號武漢軟件新城2期C11棟19層01號
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明屬于生物技術(shù)信息領(lǐng)域，具體涉及一種轉(zhuǎn)錄本分類方法，該方法是通過準(zhǔn)確定位剪切位點對轉(zhuǎn)錄本進(jìn)行分類，具體包括以下步驟：對測序所得全長轉(zhuǎn)錄本結(jié)果質(zhì)控，獲得高質(zhì)量全長轉(zhuǎn)錄本；將高質(zhì)量全長轉(zhuǎn)錄本與參考基因組比對，獲得相同基因模型下的所有轉(zhuǎn)錄本信息，去冗余，一個基因模型下的一種剪切模式只保留唯一最長的轉(zhuǎn)錄本；根據(jù)剪切位點，對全長轉(zhuǎn)錄本進(jìn)行分類，獲得初步分類結(jié)果；過濾初步分類結(jié)果，獲得最終分類結(jié)果。該方法分類準(zhǔn)確，假陽性率很低，適用性廣泛，有效解決了現(xiàn)有技術(shù)不準(zhǔn)確、分類不理想的缺陷。??