一種三代全長轉(zhuǎn)錄組輔助基因預(yù)測的方法

基本信息

申請?zhí)?/td> CN202110322129.4 申請日 -
公開（公告）號 CN113077842A 公開（公告）日 2021-07-06
申請公布號 CN113077842A 申請公布日 2021-07-06
分類號 G16B20/30（2019.01）I;G16B30/10（2019.01）I 分類 物理
發(fā)明人 鄭洪坤;劉福*;李緒明;李婧姬;王晶 申請（專利權(quán)）人 北京百邁客生物科技有限公司
代理機構(gòu) 北京路浩知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 代理人 錢云
地址 101300北京市順義區(qū)南法信鎮(zhèn)順平路南法信段9號院1幢6層605A
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明涉及生物信息技術(shù)領(lǐng)域，具體涉及一種三代全長轉(zhuǎn)錄組輔助基因預(yù)測的方法。本發(fā)明所述方法包括利用同源物種的基因信息和二代轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)信息獲取待預(yù)測物種基因組高可靠內(nèi)含子剪切位點；利用所述高可靠內(nèi)含子剪切位點，對三代全長轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)預(yù)測的內(nèi)含子剪切位點進行自動化糾正，獲取高可靠性轉(zhuǎn)錄本后進行基因結(jié)構(gòu)預(yù)測。本發(fā)明所述方法可實現(xiàn)可變剪接的預(yù)測，從而利用三代全長轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)對動植物基因組的基因結(jié)構(gòu)在全基因組水平上進行高準(zhǔn)確性的預(yù)測。