用于納米孔測序的單細胞或微量樣本全長轉(zhuǎn)錄組文庫構(gòu)建方法

基本信息

申請?zhí)?/td> CN202110312522.5 申請日 -
公開（公告）號 CN112853503A 公開（公告）日 2021-05-28
申請公布號 CN112853503A 申請公布日 2021-05-28
分類號 C40B50/06(2006.01)I;C12Q1/6869(2018.01)I 分類 -
發(fā)明人 鄭洪坤;劉敏;陳鈺萌;張夢龍 申請（專利權(quán)）人 北京百邁客生物科技有限公司
代理機構(gòu) 北京路浩知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 代理人 商秀玲
地址 101300北京市順義區(qū)南法信鎮(zhèn)順平路南法信段9號院1幢6層605A
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明涉及單細胞測序技術(shù)領(lǐng)域，具體涉及用于納米孔測序的單細胞或微量樣本全長轉(zhuǎn)錄組文庫構(gòu)建方法。本發(fā)明提供的文庫構(gòu)建方法包括：將單細胞或微量樣本裂解后，采用Smart?seq2方法將mRNA反轉(zhuǎn)錄制備cDNA，以所述cDNA為模板進行PCR擴增，將PCR擴增產(chǎn)物進行FFPE和末端修復，再連接納米孔測序接頭。該方法可以實現(xiàn)真正的單細胞測序，且兼具轉(zhuǎn)錄本覆蓋度高、分辨率高、靈活性強的優(yōu)點，可應用于單細胞的差異基因表達分析、轉(zhuǎn)錄本結(jié)構(gòu)分析、全長isoform鑒定等。??