一種聯(lián)合基因組三維結(jié)構(gòu)差異鑒定和轉(zhuǎn)錄組基因表達水平差異分析挖掘功能基因的方法

基本信息

申請?zhí)?/td> CN201910917673.6 申請日 -
公開（公告）號 CN112562783A 公開（公告）日 2021-03-26
申請公布號 CN112562783A 申請公布日 2021-03-26
分類號 G16B15/00(2019.01)I;G16B25/00(2019.01)I 分類 物理
發(fā)明人 鄭洪坤;劉福*;劉敏;李緒明;王晶;梁若冰 申請（專利權(quán)）人 北京百邁客生物科技有限公司
代理機構(gòu) 北京路浩知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 代理人 商秀玲
地址 101300北京市順義區(qū)南法信鎮(zhèn)順平路南法信段9號院1幢5層508室
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明涉及生物信息技術(shù)領(lǐng)域，具體涉及一種聯(lián)合基因組三維結(jié)構(gòu)差異鑒定和轉(zhuǎn)錄組基因表達水平差異分析挖掘功能基因的方法。本發(fā)明提供一種基因組三維結(jié)構(gòu)差異的鑒定方法，包括在Hi?C數(shù)據(jù)的基礎(chǔ)上進行差異AB Compartment的鑒定、差異TAD的鑒定和差異Loop的鑒定，利用該方法可實現(xiàn)利用原位Hi?C數(shù)據(jù)對動植物進行不同層級的基因組三維結(jié)構(gòu)差異的高效鑒定。本發(fā)明提供利用該基因組三維結(jié)構(gòu)差異鑒定方法聯(lián)合轉(zhuǎn)錄組基因表達水平差異分析挖掘功能基因的方法，利用該聯(lián)合分析方法可實現(xiàn)從基因組三維結(jié)構(gòu)與轉(zhuǎn)錄組兩個層面進行差異分析，進而實現(xiàn)對動植物功能基因的高效挖掘。??