一種基于高通量測序的建庫方法

基本信息

申請?zhí)?/td> CN202010094903.6 申請日 -
公開（公告）號 CN111321208A 公開（公告）日 2020-06-23
申請公布號 CN111321208A 申請公布日 2020-06-23
分類號 C12Q1/6869(2018.01)I 分類 生物化學(xué)；啤酒；烈性酒；果汁酒；醋；微生物學(xué)；酶學(xué)；突變或遺傳工程;
發(fā)明人 吳淵;畢書琳;李旭超;李健鵬;周文剛;鄭方克;鄭立謀 申請（專利權(quán)）人 上海廈維生物技術(shù)有限公司
代理機(jī)構(gòu) 廈門市首創(chuàng)君合專利事務(wù)所有限公司 代理人 上海廈維生物技術(shù)有限公司;上海廈維醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)實(shí)驗(yàn)室有限公司
地址 200000上海市閔行區(qū)新駿環(huán)路138號3幢201,202室
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明公開了一種基于高通量測序的建庫方法。該方法適用于片段化后的基因組DNA/FFPE RNA/cfDNActDNA等核苷酸樣本。進(jìn)一步將核苷酸樣本片段進(jìn)行修飾與變性、接頭連接，再通過對目標(biāo)區(qū)進(jìn)行兩次特異性PCR反應(yīng)富集，可得到測序文庫。對上述測序文庫進(jìn)行質(zhì)控和定量分析，可進(jìn)行高通量測序。本發(fā)明還提供了一種模擬雙鏈連接接頭。該建庫方法簡單方便，保留了基于擴(kuò)增子的多重PCR建庫方法的優(yōu)點(diǎn)，同時可以用于檢測未知融合，尤其適用于片段化程度較高的核苷酸樣本(例如cfDNA/ctDNA樣本)，對于存在損傷的DNA分子也可以用于建庫，本發(fā)明方法能夠最大程度保留所有原始核苷酸信息，且使用該方法進(jìn)行RNA建庫時不需要進(jìn)行二連合成操作。??