一種在全數(shù)字切片圖像中提取幽門(mén)螺桿菌形態(tài)的方法

基本信息

申請(qǐng)?zhí)?/td> CN201911204388.6 申請(qǐng)日 -
公開(kāi)（公告）號(hào) CN111210451A 公開(kāi)（公告）日 2020-05-29
申請(qǐng)公布號(hào) CN111210451A 申請(qǐng)公布日 2020-05-29
分類號(hào) G06T7/13 分類 計(jì)算；推算；計(jì)數(shù);
發(fā)明人 楊一明;鄭眾喜;袁勇;雷雪梅;陳杰;楊永全 申請(qǐng)（專利權(quán)）人 蘇州優(yōu)納醫(yī)療器械有限公司
代理機(jī)構(gòu) 成都高遠(yuǎn)知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理事務(wù)所（普通合伙） 代理人 蘇州優(yōu)納醫(yī)療器械有限公司
地址 215000 江蘇省蘇州市高新區(qū)泰山路2號(hào)27號(hào)廠房西
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明公開(kāi)一種在全數(shù)字切片圖像中提取幽門(mén)螺桿菌形態(tài)的方法，將待分析的WSI輸入，經(jīng)過(guò)數(shù)據(jù)處理將其切分為一系列1024*1024大小的RGB圖像。這一系列RGB圖像里面的HP分布區(qū)域需要標(biāo)注出來(lái)；采用半自動(dòng)標(biāo)注方法，首先構(gòu)建了一個(gè)用于分割HP分布區(qū)域的語(yǔ)義分割網(wǎng)絡(luò)，訓(xùn)練完成后生成模型，通過(guò)模型預(yù)測(cè)輸入RGB圖像中的HP分布區(qū)域，輸出圖像的mask將HP區(qū)域標(biāo)注出來(lái)后需要人工修正標(biāo)注；HP分布區(qū)域標(biāo)注完成后，進(jìn)行灰度處理，得到HP和背景有明顯梯度的圖像，對(duì)得到的灰度圖進(jìn)行canny邊緣檢測(cè)，提取出HP形態(tài)。本發(fā)明網(wǎng)絡(luò)規(guī)模小，速度快，用于分割HP分布區(qū)域的性能優(yōu)，保持了語(yǔ)義分割網(wǎng)絡(luò)端到端的優(yōu)點(diǎn)，可直接標(biāo)注出模型預(yù)測(cè)的HP分布區(qū)域，準(zhǔn)確度好。