一種高效低成本鑒定轉(zhuǎn)基因元件插入位點(diǎn)的方法及其應(yīng)用

基本信息

申請?zhí)?/td> CN202111517433.0 申請日 -
公開（公告）號 CN114108104A 公開（公告）日 2022-03-01
申請公布號 CN114108104A 申請公布日 2022-03-01
分類號 C40B50/06（2006.01）I;C40B40/06（2006.01）I;C12Q1/6869（2018.01）I;C12N15/11（2006.01）I;G16B30/00（2019.01）I 分類 組合技術(shù)〔8〕;
發(fā)明人 李陽;吳磊 申請（專利權(quán)）人 武漢伯遠(yuǎn)生物科技有限公司
代理機(jī)構(gòu) 武漢天領(lǐng)眾智專利代理事務(wù)所（普通合伙） 代理人 王能德
地址 430000湖北省武漢市東湖開發(fā)區(qū)高新大道666號武漢國家生物產(chǎn)業(yè)基地項(xiàng)目B、C、D區(qū)研發(fā)樓B1棟（B8-5）
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明公開了一種高效低成本鑒定轉(zhuǎn)基因元件插入位點(diǎn)的方法及其應(yīng)用，方法包括如下步驟：S1、提取轉(zhuǎn)基因陽性樣本全基因組，然后加入Tn5轉(zhuǎn)座酶進(jìn)行打斷建庫，得到第一混合物；S2、采用帶有barcode序列的引物，經(jīng)PCR擴(kuò)增所述第一混合物，得到帶有不同barcode序列的第二混合物；S3、純化所述帶有不同barcode序列的第二混合物，然后將純化后的第二混合物均一混合后，進(jìn)行高通量測序；S4、對高通量測序數(shù)據(jù)進(jìn)行數(shù)據(jù)分析，鑒定獲得轉(zhuǎn)基因元件的插入位點(diǎn)信息；本方法建庫流程簡單：采用Tn5轉(zhuǎn)座酶建庫，流程簡單快速；成本低廉：可以進(jìn)行多樣品混測，并且是利用PCR擴(kuò)增反應(yīng)靶向富集目標(biāo)序列側(cè)翼序列，對于測序量要求不高，1G測序量的成本能滿足分析幾十個樣品的分析需求。