一種區(qū)分DNA中5-甲基化胞嘧啶和5-羥甲基化胞嘧啶的方法

基本信息

申請?zhí)?/td> CN201910624669.0 申請日 -
公開（公告）號 CN110527708A 公開（公告）日 2019-12-03
申請公布號 CN110527708A 申請公布日 2019-12-03
分類號 C12Q1/6806;C12Q1/6858 分類 生物化學；啤酒；烈性酒；果汁酒；醋；微生物學；酶學；突變或遺傳工程;
發(fā)明人 劉震;李陽 申請（專利權）人 武漢伯遠生物科技有限公司
代理機構 上海精晟知識產(chǎn)權代理有限公司 代理人 穆旭
地址 430000 湖北省武漢市東湖開發(fā)區(qū)高新大道666號武漢國家生物產(chǎn)業(yè)基地項目B、C、D區(qū)研發(fā)樓B1棟(B8-5)
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明屬于表觀遺傳學技術領域，具體涉及一種區(qū)分DNA中5?甲基化胞嘧啶和5?羥甲基化胞嘧啶的方法。該方法基于APOBEC3A對5?mC和5?hmC脫氨基轉化的差異性，直接將被檢測位點作為特異性引物的3’末端，qPCR擴增后不同的甲基化修飾會產(chǎn)生不同的擴增Ct值，根據(jù)酶轉化產(chǎn)物和陰性對照之間的Ct值差異，從而快速區(qū)分被檢測位點的修飾是甲基化修飾還是羥甲基化修飾，提高了分析時效性，節(jié)約了二次測序成本。該方法轉化過程對DNA幾乎無損傷作用，可利用低至1ng的樣本DNA完成分析，能夠廣泛應用于DNA表觀遺傳分析領域。