一種哺乳動物微小核糖核酸基因預測的方法

基本信息

申請?zhí)?/td> CN201010572052.8 申請日 -
公開（公告）號 CN102485904B 公開（公告）日 2015-05-06
申請公布號 CN102485904B 申請公布日 2015-05-06
分類號 C12Q1/68(2006.01)I 分類 生物化學；啤酒；烈性酒；果汁酒；醋；微生物學；酶學；突變或遺傳工程;
發(fā)明人 陳喆;吳劍丙;劉培;葛宇清;潘輝 申請（專利權）人 深圳聯(lián)合博海生物技術有限公司
代理機構 上海光華專利事務所 代理人 浙江中醫(yī)藥大學附屬第一醫(yī)院;深圳市普力朗生物科技有限公司
地址 310006 浙江省杭州市郵電路54號
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明根據(jù)哺乳動物微小核糖核酸(microRNA)前體序列具有高度跨物種保守性的特點，從已知的微小核糖核酸序列出發(fā)，找到了一種可行的基于同源預測的微小核糖核酸基因鑒定的生物信息學方法，可直接針對微小核糖核酸基因進行鎖定，以便于進一步的生物學實驗驗證。本發(fā)明主要包括如下流程：步驟1：獲取已知哺乳動物的微小核糖核酸前體發(fā)卡環(huán)序列；步驟2：獲得未知物種的基因組序列；步驟3：利用局部比對，從基因組內(nèi)尋找微小核糖核酸的同源序列；步驟4：根據(jù)一定的標準篩選潛在的前體序列；步驟5：利用核糖核酸(RNA)二級結構折疊軟件生成二級結構；步驟6：計算二級結構自由能，篩選合格微小核糖核酸前體；步驟7：預測微小核糖核酸成熟體。最終，對于感興趣的微小核糖核酸，可以直接進行實驗驗證。