在RNA建庫過程中封閉核糖體RNA或球蛋白R(shí)NA的探針及其應(yīng)用

基本信息

申請(qǐng)?zhí)?/td> CN202111216082.X 申請(qǐng)日 -
公開（公告）號(hào) CN113862334A 公開（公告）日 2021-12-31
申請(qǐng)公布號(hào) CN113862334A 申請(qǐng)公布日 2021-12-31
分類號(hào) C12Q1/6806（2018.01）I;C12N15/11（2006.01）I;C40B50/06（2006.01）I 分類 生物化學(xué)；啤酒；烈性酒；果汁酒；醋；微生物學(xué)；酶學(xué)；突變或遺傳工程;
發(fā)明人 宋東亮;江翱;曹振;陳晶晶;侯策;王嫚;劉倩 申請(qǐng)（專利權(quán)）人 翌圣生物科技（上海）股份有限公司
代理機(jī)構(gòu) 蘇州根號(hào)專利代理事務(wù)所（普通合伙） 代理人 朱華慶
地址 200120上海市浦東新區(qū)天雄路166弄1號(hào)樓402室
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明提供一種在RNA建庫過程中封閉核糖體RNA或球蛋白R(shí)NA的探針，探針長度為35?60 nt，探針與核糖體RNA或球蛋白R(shí)NA通過互補(bǔ)配對(duì)形成三元封閉復(fù)合物。探針的后半?yún)^(qū)域與靶RNA嚴(yán)格互補(bǔ)配對(duì)，探針配對(duì)區(qū)域的5’端5?9個(gè)堿基被修飾堿基代替；探針的前半?yún)^(qū)域是嘧啶堿基，用于嵌合到DNA/RNA雙鏈的大溝中形成三元復(fù)合物。探針的3’?OH利用MGB進(jìn)行封閉，用于防止探針作為引物進(jìn)行延伸；同時(shí)MGB可嵌合到DNA/RNA雙鏈的小溝，提高三元復(fù)合物的穩(wěn)定性。并公開了其在RNA建庫中快速去除核糖體RNA或球蛋白R(shí)NA的應(yīng)用。本發(fā)明具有操作簡單、耗時(shí)極短、特異性強(qiáng)、適用性廣、去除效率高和基因檢出數(shù)高等優(yōu)點(diǎn)，適合用于工業(yè)自動(dòng)化建庫和疾病快速診斷領(lǐng)域。