構(gòu)建對(duì)核酸序列進(jìn)行分類的模型方法及其應(yīng)用
基本信息
| 申請(qǐng)?zhí)?/td> | CN202011523286.3 | 申請(qǐng)日 | - |
| 公開（公告）號(hào) | CN112599196B | 公開（公告）日 | 2021-11-05 |
| 申請(qǐng)公布號(hào) | CN112599196B | 申請(qǐng)公布日 | 2021-11-05 |
| 分類號(hào) | G16B30/00;G16B40/00 | 分類 | 物理 |
| 發(fā)明人 | 張延明;趙增祥;杜楠;張萱;朱政英;萬麗君;王麗娜;侯全民 | 申請(qǐng)（專利權(quán)）人 | 北京諾賽基因組研究中心有限公司 |
| 代理機(jī)構(gòu) | 北京漢鼎理利專利代理事務(wù)所（特殊普通合伙） | 代理人 | 潘滿根 |
| 地址 | 100176 北京市大興區(qū)北京經(jīng)濟(jì)技術(shù)開發(fā)區(qū)永昌北路3號(hào)1號(hào)樓1層01 | ||
| 法律狀態(tài) | - | ||
摘要
| 摘要 | 本發(fā)明提供一種構(gòu)建對(duì)核酸序列進(jìn)行分類的模型方法，所述方法包括收集帶有準(zhǔn)確分類標(biāo)簽的核酸序列構(gòu)建核酸序列數(shù)據(jù)庫，將核酸序列數(shù)據(jù)庫中所有核酸序列分割成等長(zhǎng)度的短序列，從而形成短核酸序列均衡樣本，根據(jù)所述核酸序列數(shù)據(jù)庫中的核酸序列，提取核酸Kmer，形成核酸序列的Kmer字典；將短核酸序列均衡樣本轉(zhuǎn)化成數(shù)字信號(hào)；使用數(shù)字信號(hào)訓(xùn)練一個(gè)能對(duì)核酸序列進(jìn)行多分類的神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)分類器。通過本發(fā)明方法構(gòu)建的模型，能夠準(zhǔn)確快速地將待測(cè)核酸序列與數(shù)據(jù)庫中的核酸序列標(biāo)簽進(jìn)行對(duì)應(yīng)分類，并展示每個(gè)標(biāo)簽的可靠性分值，通過可靠性分值可以判定待檢測(cè)核酸序列是否由數(shù)據(jù)庫中的序列重組而成，或者根據(jù)同一樣本基因組上的不同核酸序列片段的檢測(cè)結(jié)果進(jìn)一步確定樣本的標(biāo)簽。 |
