一種基于深度學(xué)習(xí)的基因型預(yù)測(cè)方法
基本信息
| 申請(qǐng)?zhí)?/td> | CN201810364531.7 | 申請(qǐng)日 | - |
| 公開(kāi)（公告）號(hào) | CN110400597A | 公開(kāi)（公告）日 | 2019-11-01 |
| 申請(qǐng)公布號(hào) | CN110400597A | 申請(qǐng)公布日 | 2019-11-01 |
| 分類(lèi)號(hào) | G16B5/00（2019.01）I; G16B25/00（2019.01）I | 分類(lèi) | 物理 |
| 發(fā)明人 | 葉偉健; 楊武兵; 王勉 | 申請(qǐng)（專(zhuān)利權(quán)）人 | 成都二十三魔方生物科技有限公司 |
| 代理機(jī)構(gòu) | 深圳市萬(wàn)商天勤知識(shí)產(chǎn)權(quán)事務(wù)所（普通合伙） | 代理人 | 王志明;羅建平 |
| 地址 | 610000 四川省成都市高新區(qū)天府大道中段1366號(hào)E區(qū)2號(hào)樓10層16、17、18號(hào)房 | ||
| 法律狀態(tài) | - | ||
摘要
| 摘要 | 本發(fā)明公開(kāi)了一種基于深度學(xué)習(xí)的基因型預(yù)測(cè)方法，包括以下步驟：A：根據(jù)收集到的基因片段，構(gòu)建初步訓(xùn)練集合；B：為初步訓(xùn)練集合進(jìn)行基因定相，并對(duì)基因定相之后的兩條單倍型進(jìn)行0，1，0.5編碼；將編碼后的數(shù)據(jù)分割成一次訓(xùn)練集合和測(cè)試集合；C：按取得的相鄰SNP位點(diǎn)構(gòu)建神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型，并使用一次訓(xùn)練集合訓(xùn)練模型；D：將測(cè)試集合經(jīng)過(guò)步驟A、B處理后代入通過(guò)訓(xùn)練好的神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型，求出測(cè)試集的預(yù)測(cè)值和模型可信度；E：將實(shí)際需要預(yù)測(cè)的基因序列做處理后代入模型，截取可信度達(dá)到一定程度的位點(diǎn)作為有效預(yù)測(cè)，輸出結(jié)果。通過(guò)本發(fā)明可解決現(xiàn)有的基因預(yù)測(cè)技術(shù)需要消耗大量計(jì)算資源，耗時(shí)過(guò)長(zhǎng)的問(wèn)題。 |
