一種提高宏基因組納米孔測(cè)序數(shù)據(jù)菌種組裝效率的方法

基本信息

申請(qǐng)?zhí)?/td> CN202110927474.0 申請(qǐng)日 -
公開（公告）號(hào) CN113611359A 公開（公告）日 2021-11-05
申請(qǐng)公布號(hào) CN113611359A 申請(qǐng)公布日 2021-11-05
分類號(hào) G16B20/20（2019.01）I 分類 物理
發(fā)明人 李振中;陳莉;李珊;戴巖;李詩濛;任用 申請(qǐng)（專利權(quán)）人 江蘇先聲醫(yī)學(xué)診斷有限公司
代理機(jī)構(gòu) - 代理人 -
地址 210042江蘇省南京市玄武區(qū)玄武大道699-18號(hào)28幢
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明提供一種通過降維聚類分群提高宏基因組測(cè)序數(shù)據(jù)菌種組裝效率的方法，所述方法通過k?mer頻率或頻數(shù)統(tǒng)計(jì)，在組裝前進(jìn)行降維預(yù)分群，能夠顯著提高宏基因組組裝效率，組裝時(shí)間至少減少一半以上，同時(shí)保證生信鑒定的有效性和準(zhǔn)確性。