一種優(yōu)化的kraken2算法及其在二代測(cè)序中的應(yīng)用

基本信息

申請(qǐng)?zhí)?/td> CN202110804351.8 申請(qǐng)日 -
公開(公告)號(hào) CN113539369A 公開(公告)日 2021-10-22
申請(qǐng)公布號(hào) CN113539369A 申請(qǐng)公布日 2021-10-22
分類號(hào) G16B30/10 分類 物理
發(fā)明人 張巖;李振中;任用;李詩(shī)濛;郭昊;梁相志;陳莉;戴巖;李珊;顧菊 申請(qǐng)(專利權(quán))人 江蘇先聲醫(yī)學(xué)診斷有限公司
代理機(jī)構(gòu) - 代理人 -
地址 210032 江蘇省南京市玄武區(qū)玄武大道699-18號(hào)28幢
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明提供了一種基于kraken2單條序列kmer評(píng)分和整體基于taxonomy結(jié)構(gòu)統(tǒng)計(jì)的生信分析方法,所述方法能夠降低生信分析假陽性,提高物種檢測(cè)準(zhǔn)確度,適用于二代宏基因組測(cè)序分析。